Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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