Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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