Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.444e-6■■□□□ 12
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PCBP1Q15365 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 410.94□□□□□ -0.663e-16■■□□□ 12
PCBP1Q15365 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 410.36□□□□□ -0.753e-16■■□□□ 12
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PCBP1Q15365 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 29.5□□□□□ -0.893e-16■■□□□ 12
PCBP1Q15365 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 48.19□□□□□ -1.13e-16■■□□□ 12
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PCBP1Q15365 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.82□□□□□ -1.163e-16■■□□□ 12
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PCBP1Q15365 POLE3-201ENST00000374169 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.466e-19■■□□□ 12
PCBP1Q15365 HMGA2-211ENST00000545998 1584 ntTSL 1 (best)22.62■■□□□ 1.214e-8■■□□□ 12
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PCBP1Q15365 UBE2L3-202ENST00000458578 3007 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.63e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.371e-12■■□□□ 12
PCBP1Q15365 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-12■■□□□ 12
PCBP1Q15365 GRSF1-202ENST00000499044 2491 ntTSL 217.87■□□□□ 0.453e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■□□□ 12
PCBP1Q15365 GRSF1-204ENST00000505068 3561 ntTSL 213.04□□□□□ -0.323e-6■■□□□ 12
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PCBP1Q15365 INF2-201ENST00000252527 3050 ntTSL 214.49□□□□□ -0.093e-7■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-7■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-7■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-6■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.363e-6■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.263e-6■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.083e-6■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.273e-6■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 STMN1-205ENST00000446334 665 ntTSL 26.78□□□□□ -1.323e-6■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 STMN1-207ENST00000465604 2947 ntTSL 1 (best)4.45□□□□□ -1.73e-6■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 PABPC1-224ENST00000610907 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.652e-18■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 CCNI-209ENST00000515790 390 ntTSL 212.32□□□□□ -0.442e-8■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 SERPINA1-217ENST00000557118 583 ntTSL 414.99□□□□□ -0.011e-323■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.971e-10■■□□□ 11.9
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PCBP1Q15365 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.691e-10■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 EPS8L2-210ENST00000527807 814 ntTSL 524.65■■□□□ 1.541e-9■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 EPS8L2-224ENST00000533500 587 ntTSL 323.65■■□□□ 1.381e-9■■□□□ 11.9
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PCBP1Q15365 EPS8L2-229ENST00000534755 474 ntTSL 423.04■■□□□ 1.281e-9■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 PAWR-206ENST00000548426 494 ntTSL 322.53■■□□□ 1.24e-7■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 EPS8L2-203ENST00000524763 580 ntTSL 321.23■□□□□ 0.991e-9■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.764e-7■■□□□ 11.9
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PCBP1Q15365 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.654e-7■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 EPS8L2-216ENST00000530118 561 ntTSL 318.6■□□□□ 0.571e-9■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 URM1-206ENST00000483206 731 ntTSL 216.88■□□□□ 0.298e-13■■□□□ 11.9
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PCBP1Q15365 ATG4B-213ENST00000460211 871 ntTSL 216.59■□□□□ 0.254e-7■■□□□ 11.9
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PCBP1Q15365 ATG4B-224ENST00000494132 828 ntTSL 216.23■□□□□ 0.194e-7■■□□□ 11.9
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PCBP1Q15365 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.238e-10■■□□□ 11.9
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PCBP1Q15365 SRP54-213ENST00000556994 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.598e-10■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 SRP54-208ENST00000555557 1949 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.648e-10■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 ARID1B-210ENST00000635849 5830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.784e-7■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.844e-7■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 STX16-NPEPL1-201ENST00000413559 557 ntTSL 37.98□□□□□ -1.134e-7■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC6.44□□□□□ -1.384e-7■■□□□ 11.9
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PCBP1Q15365 RPL10-212ENST00000479366 569 ntTSL 414.78□□□□□ -0.045e-78■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 FAM117A-208ENST00000511743 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.44□□□□□ -0.422e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.252e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 TRPM4-206ENST00000595882 579 ntTSL 428.51■■■□□ 2.152e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.112e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 LBR-203ENST00000421383 736 ntTSL 327.77■■■□□ 2.042e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.753e-14■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.712e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 525.08■■□□□ 1.612e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.522e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PANK4-207ENST00000491212 725 ntTSL 324.52■■□□□ 1.522e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 LYL1-203ENST00000590974 902 ntTSL 324.45■■□□□ 1.53e-14■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.52e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RBM38-201ENST00000342690 852 ntTSL 324.17■■□□□ 1.462e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.463e-14■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.392e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MBD6-212ENST00000552163 570 ntTSL 323.55■■□□□ 1.362e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RCOR3-205ENST00000472734 452 ntTSL 223.42■■□□□ 1.342e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.32e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPLP0-222ENST00000551336 406 ntTSL 322.13■■□□□ 1.139e-41■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 STXBP2-216ENST00000599648 472 ntTSL 221.04■□□□□ 0.962e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 TRPM4-204ENST00000595071 2947 ntTSL 219.92■□□□□ 0.782e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RBM38-202ENST00000344785 2193 ntTSL 519.42■□□□□ 0.72e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 11.8
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