Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms