Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EBI3Q14213 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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EBI3Q14213 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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EBI3Q14213 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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EBI3Q14213 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EBI3Q14213 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EBI3Q14213 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EBI3Q14213 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EBI3Q14213 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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