Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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SEMA3BQ13214 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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SEMA3BQ13214 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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SEMA3BQ13214 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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SEMA3BQ13214 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SEMA3BQ13214 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SEMA3BQ13214 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SEMA3BQ13214 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SEMA3BQ13214 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SEMA3BQ13214 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3BQ13214 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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