Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBQ06643 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBQ06643 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LTBQ06643 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LTBQ06643 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LTBQ06643 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms