Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCS1P62166 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCS1P62166 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCS1P62166 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCS1P62166 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCS1P62166 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCS1P62166 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCS1P62166 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCS1P62166 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCS1P62166 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms