Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAG2P55895 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAG2P55895 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAG2P55895 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAG2P55895 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAG2P55895 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAG2P55895 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAG2P55895 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms