Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DAP3P51398 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DAP3P51398 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DAP3P51398 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DAP3P51398 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DAP3P51398 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DAP3P51398 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms