Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms