Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

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Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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