Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GJA4P35212 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GJA4P35212 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GJA4P35212 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GJA4P35212 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GJA4P35212 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms