Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA5P31644 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms