Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC192P0DO97 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms