Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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