Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF3O43395 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF3O43395 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF3O43395 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF3O43395 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF3O43395 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF3O43395 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF3O43395 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF3O43395 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms