Protein–RNA interactions for Protein: O15440

ABCC5, Multidrug resistance-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC5O15440 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC5O15440 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms