Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms