Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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