Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms