Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms