Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms