Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY2Q8WXA3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms