Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RTL6Q6ICC9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL6Q6ICC9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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