Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms