Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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NR6A1Q15406 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR6A1Q15406 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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