Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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