Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL4BQ13620 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4BQ13620 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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