Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
UBE2V1Q13404 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
UBE2V1Q13404 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
UBE2V1Q13404 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
UBE2V1Q13404 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
UBE2V1Q13404 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
UBE2V1Q13404 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
UBE2V1Q13404 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UBE2V1Q13404 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms