Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPTFQ12830 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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