Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TWF1Q12792 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TWF1Q12792 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TWF1Q12792 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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