Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms