Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINB3P29508 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms