Protein–RNA interactions for Protein: P01229

LHB, Lutropin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHBP01229 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHBP01229 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHBP01229 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHBP01229 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LHBP01229 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHBP01229 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms