Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCTN3O75935 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms