Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
NDUFS5O43920 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NDUFS5O43920 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms