Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM6BO15054 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms