Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms