Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2D9

IGKV1D-13, Immunoglobulin kappa variable 1D-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms