Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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