Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GALPQ9UBC7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALPQ9UBC7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms