Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPHNQ9NQX3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms