Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE7BQ9NP56 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE7BQ9NP56 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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