Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms