Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIN2AQ99865 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms