Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMD4Q96H15 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMD4Q96H15 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms