Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms