Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRF1Q92994 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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BRF1Q92994 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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BRF1Q92994 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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BRF1Q92994 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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BRF1Q92994 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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