Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RABGGTAQ92696 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms